آتن تنها پایتخت اروپایی است كه هیچ مسجد جامعی ندارد. دولت یونان پس از مهاجرت هزاران مسلمان به این شهر سرانجام در سال ۲۰۱۱ میلادی مجبور به صدور قانون ساخت یك مسجد در این شهر شد. اما این مسجد پس از كشمكش‌های بسیار، اخیراً در مراحل اولیه ساخت قرار گرفته است.

تنها مسجد رسمی یونان در منطقه "تراكیه" واقع در شمال شرق این كشور قرار دارد كه اقلیت مسلمان ساكن در این منطقه ترك تبار هستند.